Daan H. de Groot
Daan H. de Groot
PhD Student Systemsbioinformatics, Vrije Universiteit
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The number of active metabolic pathways is bounded by the number of cellular constraints at maximal metabolic rates
DH De Groot, C Van Boxtel, R Planqué, FJ Bruggeman, B Teusink
PLoS computational biology 15 (3), e1006858, 2019
17*2019
In vivo characterisation of fluorescent proteins in budding yeast
D Botman, DH de Groot, P Schmidt, J Goedhart, B Teusink
Scientific reports 9 (1), 1-14, 2019
112019
The common message of constraint-based optimization approaches: overflow metabolism is caused by two growth-limiting constraints
DH De Groot, J Lischke, R Muolo, R Planqué, FJ Bruggeman, B Teusink
Cellular and Molecular Life Sciences 77 (3), 441-453, 2020
62020
Elementary Growth Modes provide a molecular description of cellular self-fabrication
DH De Groot, J Hulshof, B Teusink, FJ Bruggeman, R Planqué
PLoS computational biology 16 (1), e1007559, 2020
22020
Cell fate determination by Lamarckian molecule-inheritance and chance
FJ Bruggeman, J Schouten, DH de Groot, R Planqué
bioRxiv, 618199, 2019
22019
Elementary Conversion Modes Unveil All Capabilities of Metabolic Networks
TJ Clement, EB Baalhuis, B Teusink, FJ Bruggeman, R Planqué, ...
Available at SSRN 3671940, 2020
2020
Elementary Conversion Modes enable exploration of all metabolic capabilities of any organism
TJ Clement, EB Baalhuis, B Teusink, FJ Bruggeman, R Planqué, ...
bioRxiv, 2020
2020
1 Elementary Flux Modes, enzymatic constraints, and cost vec-tors
DH de Groot, C van Boxtel, R Planqué, FJ Bruggeman, B Teusink
2018
rates, at balanced growth
DH de Groot, J Hulshof, B Teusink, FJ Bruggeman, R Planqué
RESEARCH OUTPUTS/RÉSULTATS DE RECHERCHE
D De Groot, J Lischke, R Muolo, R Planqué, FJ Bruggeman, B Teusink
Supporting Information: The common message of constraint-based optimization approaches: overflow metabolism is caused by two growth-limiting constraints
DH de Groot, J Lischke, R Muolo, R Planqué, FJ Bruggeman, B Teusink
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