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Charles Bettembourg
Charles Bettembourg
Data scientist
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The RESOLUTE consortium: unlocking SLC transporters for drug discovery
G Superti-Furga, D Lackner, T Wiedmer, A Ingles-Prieto, B Barbosa, ...
Nature reviews Drug discovery 19 (7), 429-430, 2020
662020
The duplicated genes database: identification and functional annotation of co-localised duplicated genes across genomes
M Ouedraogo, C Bettembourg, A Bretaudeau, O Sallou, C Diot, ...
PloS one 7 (11), e50653, 2012
632012
Semantic particularity measure for functional characterization of gene sets using gene ontology
C Bettembourg, C Diot, O Dameron
PloS one 9 (1), e86525, 2014
202014
Measuring the evolution of ontology complexity: the gene ontology case study
O Dameron, C Bettembourg, N Le Meur
PLoS One 8 (10), e75993, 2013
172013
GO2PUB: Querying PubMed with semantic expansion of gene ontology terms
C Bettembourg, C Diot, A Burgun, O Dameron
Journal of biomedical semantics 3, 1-12, 2012
172012
Optimal threshold determination for interpreting semantic similarity and particularity: application to the comparison of gene sets and metabolic pathways using GO and ChEBI
C Bettembourg, C Diot, O Dameron
PloS one 10 (7), e0133579, 2015
162015
ABHD11, a new diacylglycerol lipase involved in weight gain regulation
J Escoubet, M Kenigsberg, M Derock, V Yaligara, MD Bock, S Roche, ...
PLoS One 15 (6), e0234780, 2020
72020
AskOmics: Intégration et interrogation de réseaux de régulation génomique et post-génomique
C Bettembourg, O Dameron, A Bretaudeau, F Legeai
IN OVIVE (INtégration de sources/masses de données hétérogènes et Ontologies …, 2015
42015
A2Sign: Agnostic Algorithms for Signatures—a universal method for identifying molecular signatures from transcriptomic datasets prior to cell-type deconvolution
G Boldina, P Fogel, C Rocher, C Bettembourg, G Luta, F Augé
Bioinformatics 38 (4), 1015-1021, 2022
12022
The Duplicated Genes Database: Identification and Functional Annotation of
M Ouedraogo, C Bettembourg, A Bretaudeau, O Sallou, C Diot
Co-Localised Duplicated Genes across Genomes 7 (11), 1-8, 2012
12012
Quantitative cross-species comparison of GO annotations: advantages and limitations of semantic similarity measure
O Dameron, C Bettembourg, L Joret
INSERM U936, France, 2010
12010
ASigNTF: Agnostic Signature using NTF–a universal agnostic strategy to estimate cell-types abundance from transcriptomic datasets
P Fogel, G Boldina, C Rocher, C Bettembourg, G Luta, F Augé
bioRxiv, 2021.02. 04.429589, 2021
2021
Identification of causal signature using omics data integration and network reasoning-based analysis
M Wery, E Becker, F Auge, C Bettembourg, O Dameron, A Siegel
JOBIM 2019-Journées Ouvertes Biologie, Informatique et Mathématiques, 1, 2019
2019
Comparative genomic analysis of Clubroot resistance in the Brassicaceae family
A Evrard, C Bettembourg, O Dameron, O Filangi, A Bretaudeau, ...
Brassica2016, 2016
2016
BIPAA/Askomics, a new and easy approach for querying genomics and epigenomics elements in interaction
F Legeai, C Bettembourg, A Bretaudeau, Y Chaussin, O Dameron, ...
XXVth International Congress of Entomology 2016, 2016
2016
Integration and query of biological datasets with Semantic Web technologies: AskOmics
A Evrard, C Bettembourg, M Jubault, O Dameron, O Filangi, A Bretaudeau, ...
Journées Ouvertes Biologie, Informatique et Mathématiques (JOBIM 2016), 2016
2016
Méthodes sémantiques pour la comparaison inter-espèces de voies métaboliques: application au métabolisme des lipides chez l'humain, la souris et la poule
C Bettembourg
Rennes 1, 2013
2013
GO2PUB
C Bettembourg, O Dameron, C Diot, A Burgun
2012
Comparaison inter-espèces de voies métaboliques par mesure de similarité sémantique
C Bettembourg, O Dameron, A Burgun, C Diot
Ecole chercheurs en Biologie Intégrative et Génomique dans le Grand Ouest …, 2011
2011
Cross-Species Metabolic Pathways Comparison–Focus on Mouse, Human and Chicken Lipid Metabolism
C Bettembourg, C Diot, O Dameron
BMC Bioinformatics 11 (449), 2010
2010
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