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Hélène Lopez-Maestre
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TEtools facilitates big data expression analysis of transposable elements and reveals an antagonism between their activity and that of piRNA genes
E Lerat, M Fablet, L Modolo, H Lopez-Maestre, C Vieira
Nucleic acids research 45 (4), e17-e17, 2016
1072016
SNP calling from RNA-seq data without a reference genome: identification, quantification, differential analysis and impact on the protein sequence
H Lopez-Maestre, L Brinza, C Marchet, J Kielbassa, S Bastien, ...
Nucleic Acids Research 44 (19), e148-e148, 2016
942016
Identification of misexpressed genetic elements in hybrids between Drosophila-related species
H Lopez-Maestre, EAG Carnelossi, V Lacroix, N Burlet, B Mugat, ...
Scientific Reports 7, 2017
382017
Transposable Element Misregulation Is Linked to the Divergence between Parental piRNA Pathways in Drosophila Hybrids
V Romero-Soriano, L Modolo, H Lopez-Maestre, B Mugat, E Pessia, ...
Genome biology and evolution 9 (6), 1450-1470, 2017
312017
Playing hide and seek with repeats in local and global de novo transcriptome assembly of short RNA-seq reads
L Lima, B Sinaimeri, G Sacomoto, H Lopez-Maestre, C Marchet, V Miele, ...
Algorithms for molecular biology 12 (1), 1-19, 2017
232017
Rapid protection induced by a single-shot Lassa vaccine in male cynomolgus monkeys
M Mateo, S Reynard, N Pietrosemoli, E Perthame, A Journeaux, K Noy, ...
Nature Communications 14 (1), 1352, 2023
62023
Throughout in vitro first spermatogenic wave: Next-generation sequencing gene expression patterns of fresh and cryopreserved prepubertal mice testicular tissue explants
L Dumont, H Lopez Maestre, F Chalmel, L Huber, A Rives-Feraille, ...
Frontiers in Endocrinology 14, 1112834, 2023
32023
Analyses et méthodes pour les données transcriptomiques issues d’espèces non modèles: Variation de l’expression des éléments transposables (et des gènes) et variants nucléotidiques
H Lopez-Maestre
Université Claude Bernard Lyon 1, 2017
22017
Les cellules MAIT (Mucosal-associated invariant T) sont impliquées dans la physiopathologie du psoriasis
T Stephen, A Dangien, C Leloup, I Mezghiche, L Camard, ...
Annales de Dermatologie et de Vénéréologie-FMC 2 (8), A111, 2022
2022
IL-23 Signaling Induces Autoimmune Disease Genes in Mucosal-Associated Invariant T Cells
T Stephen, A Dangien, C Leloup, I Mezghiche, L Camard, ...
ARTHRITIS & RHEUMATOLOGY 74, 3437-3438, 2022
2022
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